传统科学对世界的认识和对社会的进步做出了巨大的贡献，但是传统科学并不是万能的，它不能解决现代的一切问题；且传统科学的一些旧观点，也因科学的进步而遭到置疑。因此有眼光的科学家都承认传统科学的局限性，如:中国工程院副院长杜祥琬说：在认识宏观世界和微观世界这两个方向上我们都还是未知多于已知。著名物理学家郭汉英说，目前物理学对宇宙的了解，包括猜想只有4%，而完全不知的竟占到了70%。2004年诺贝尔物理学奖得主大卫·格罗斯，在他获奖同年提出的观点：“知识最重要的产品是无知。”但总有一些科学家以这4%的知识来评判世界,发现解释不了的现象就给一顶“伪科学”的帽子,比较有名的是苏联时期的李森科之流,他们给摩根的遗传基因学说戴过这个帽子,万幸还有人不理他们那一套，才有今天遗传基因科学的辉煌。李森科在国外有，在中国也有。
        科学传到中国以后，中医和风水就遭到了拷问，本来这是一种文化碰撞，是种学术交锋，无可厚非，当行政介入时就是另一回事了。中医在1912年被汪大燮教育部长赶出学校，1929年2月27日国民政府动议“废止中医”，会上医师公会会长余云岫提出“废止旧医以扫除医事卫生之障碍案”。废止的理由就是“不科学”，当时还没有发明“伪科学”这帽子。余会长没有搞错，中医不管从那方面看都不符合传统意义上的科学。当代著名中医、中国中医科学院研究员,中央保健局高级顾问陆广莘2006年3月在凤凰卫视上底气十足地说：“中医不是科学”，但这并不妨碍它几千年来有效地为中国的老百姓服务，并且大有走向国际的态势，世界已有140多个国家接受了中医，科学最解释不了的针灸已被科学最发达的美国人接受了，这又可能是我们那位余会长所始料未及的。 前段时间中国又有一批科学家在起哄要取消中医，当然遭全国上下绝大部分人的反对，更惨的是奉行科学主义的美国，居然也不买账，最近给中医戴一顶东方科学的帽子，并列入医保报销范围。这实际上是美国人抬举了中医，中医和风水一样都是用现代科学解释不了的。
        解放后政府通过行政干预，使中医合法化，却拼命地把中医往西医里套，“中西医结合”就是一大杰作。从病人角度说用中医的办法治疗的同时也结合用西医西药的办法治疗，从医生角度说学会了中医的同时也掌握西医知识，这两种“中西医结合”是可行的。否则，由于中医中药和代表传统科学的西医西药实际上是东西方两种完全不同的思维理论体系，中医使用的是东方的整体论思维方式，而西医使用的是西方的还原论思维方式；在中医师眼里病人是完整的活泼泼的一个“人”，在西医师眼中病人只是一种“病”；中医只管“症状”而不必管“病源”，而西医管“病源”却不管“症状”。就思想方法体系来说中医并不比西医落后，哈肯(H.　Haken)创立“协同学”就是受到中医等东方思维的启发而创立的学说。就方法体系来说，它们是无法结合的。你说西医能承认整体阴阳平衡和腑脏五行生克循环理论吗，放弃了这些还是中医吗？中医能放弃整体的“人”而“头痛医头脚痛医脚”去治“病”吗？硬性结合只会使中医“不仅没有得到长足的发展，反而伤害到了我们的自信。”陆广莘说：“中医是不科学的，但中医超越科学。”山东省中医药大学校长王新陆先生“认为中医的发展是现代科学现在还不能认识，”中医需要撇开传统科学的羁绊，走自己的路，只有医疗效果才是检验中医的标准。剑桥大学教授李约瑟警戒我们中医和西医要‘注意！一列火车也许会遮挡另一列火车！’。
       解放前风水因为相对低调，没有登入大雅之门，所以科学也没有大兴讨伐之举，近代也一直在民间流行。但在解放后相当长的一段时间里，从事风水活动绝对是封建迷信诈骗罪，抓你没商量，至今在辞海里对风水的解释也还是叫“迷信”。现在有一批学者、教授，痛心于中国的传统文化的沦失，疾呼还风水一席之地，想通过给风水穿上“科学”的外衣，来为它争取合法地位。他们的用心固然良苦，但是要说风水是科学的，特别说是传统科学，却很难说得通。风水没有办法像烧开水一样，给足条件就可以反复把水烧开，这除了风水的时空性无法完全满足外，也还有些现在说不清的因素。香港的风水师们自认“风水学用现代科学的眼光来看，不是一门科学”。传统科学是建立在逻辑学上的，逻辑学的一就是一，你就是你，我就是我，是确定的；而在风水中的一（乾）是一是六是九还是八，你是你是他是我还是她是不确定的。这是传统科学所无法接受的，倒是和现代科学中量子理论的重叠原理或者不确定性原理有相通之处。这些原理中国人已运用了几千年了，而西方科学却刚刚才发现。就方法论而言，风水要比传统科学“先进”得多，这实际上也是许多人理解不了风水的一个原因，而以为风水故弄玄虚。
       现代科学中的尖兵量子理论、场的理论、暗物质理论、反物质理论以及五维空间的理论发展，也许将来能解释中医和风水现象，特别是“自然场”的理论。赫尔蒙特和迈斯默通过实验发现：生命体和无生命体都有一种"流体”，并能间隔一定距离而相互作用，这与引力无关。冯·赖欣巴赫花了三十年时间对这种“场”进行实验。他的实验证实了这个场的存在。他称“自然场”具有如下特性：（1)具有类似电磁场的性质，不仅表现出磁极性，而且具有其独特极性，类似于晶体中沿主轴方向出现的极性。（2)具有传导性，如导线，取决于物质的质量密度，而不取决于物质的导电性。（3)这种场的一部分可用透镜聚焦，另一部分环绕流过，类似于气流。近年，美国科学家又利用光电倍增管和电视图像处理技术，记录人体周围的人体场，而且这种场和人的主观意识有关，思想集中信号增加。我相信这种“自然场”就是中医和风水理论中的“气”。我们正是通过中医来调理人体的气，达到调理身体，维持健康的；通过风水“裁成”来调整“自然场”即“气”的布局，通过风水仪式如“呼龙”、祭祀等活动来连通和强化气场。
        英国剑桥大学著名教授李约瑟博士在《中国古代科学技术史》中说：“中国古代风水术是准科学的。”美国威斯康星州麦迪逊大学终身教授、环境设计专业主任董伟说：风水如今在西方世界已经成了中国文化的标志。美国最著名的伯克利大学早在1973年就开始招风水博士研究生，欧洲人也热此不疲，世界第一届风水大会就在欧洲举办，日本有110所大学都正式地开风水班，俄罗斯风水热也风起如潮。
       世界如此高看中国传统中医和风水，我们却还是自宫不已。似乎风水是中国人的一种耻辱，必欲去之而后快，是可怜，还是可悲。现在是我们理直气壮地说风水是中国的民俗，是中国的方技，是我们民族文化的一部分，现在是炎黄子孙骄傲的时候了。 我们不反对用现代科学的技术对中医和风水进行研究，但不需要它来发通行证。我们为什么要用“落后”的传统科学来束缚自己呢？我们应该坚持传统特色，坚持实践是检验真理的标准，继续研究它，发展它，像遗传基因学一样，反过来推动科学的发展。